根據中華人民共和國水利部批準發布的《小型水電站建設工程驗收規程》（SL168-96），2013年8月19日，由新疆維吾爾自治區水電及農村電氣化發展局主持，博州水利局、博州水利水電質量監督站、溫泉縣水利局、博爾塔拉電業局及特邀專家組成驗收委員會，會同項目建設單位、監理、設計、施工單位，對鄂托克賽爾水電站工程進行了啟動驗收。
2013年8月19日上午，驗收組在鄂托克賽爾水電站現場實地進行檢查，下午對工程資料進行了查驗。鄂托克賽爾水電站工程三臺機組已全部完工，滿足機組啟動運行的條件，與機組啟動有關的分部工程施工質量合格，經鄂托克賽爾水電站機組啟動驗收委員會討論并通過鄂托克賽爾水電站工程啟動驗收鑒定書，鑒定結論為合格。
